若檀香手串污垢較少，可以用棉布沾一點水后擦拭干凈即可。若檀香手串污垢較多，可以將它放在清水下沖洗干凈后置于陰涼處晾干。若是老檀香手串最好1-2年清潔一次，用半濕的棉布包裹一會，再擦拭晾干即可。
如果檀香手串表面的污垢不多，臟的不是很厲害的情況，可以用一塊棉布沾濕一點水后擦拭，將檀香珠子一顆一顆的、反復擦，擦掉污垢后再把檀香手串放在陰涼的地方晾干就可以了。
如果檀香手串表面的污垢很多，臟的很嚴重，最好對檀香手串進行全面清洗，可以把整串檀香手串放到清水下沖洗，再用干棉布擦干，必須擦干水分，放置在陰涼的地方晾干，等檀香手串晾干以后用棉布盤一段時間，檀香手串就變得干凈、有光澤了。
如果檀香手串是用老檀香制成，價值比較高，最好定期清潔，一般是1-2年清洗一次，清洗時用半濕的棉布將檀香手串包裹一段時間，軟化污垢后，再進行擦拭和晾干，檀香手串就恢復干凈了。
