在凈化黃水晶的時候，可采用日光沐浴法進行，主要將其放在溫和的陽光下照射幾個小時，以去除里面的負面能量，或者采用海鹽法進行消磁，主要將其放在一個干凈的容器里，在里面放入適量的粗鹽和礦泉水，讓其浸泡一晚上后取出來洗干凈為宜。
1、日曬法：挑一個晴朗的天氣，利用陽光直接照射，最好是在下午二點之前，可讓陽光照射幾個小時，但不宜強光暴曬，以利用陽光去除里面存留的負面能量，使其達到凈化的目的。
2、土埋法：可將黃水晶埋在沒有埋過任何動物的土壤中，讓它接近大自然約三十天左右，因為土壤是具有強大的生育能力，而可以奪取毒素，并吸入巨大的能量，過后再用礦泉水洗凈為宜。
3、海鹽法：或者可以采用海鹽法進行消磁，主要將其放在一個干凈的容器中，在里面放入一些適量的海鹽，在里面加入等量的礦泉水，讓其浸泡一個晚上，待第二天的時候取出來洗干凈就可以，這也是黃水晶簡單凈化方法之一。
